En sus 20 años como profesional únicamente defendió los colores de un club, el AC Milan, del que se convirtió en santo y seña disputando 719 partidos, solo por detrás de otro mito como Paolo Maldini.
En esas 20 temporadas logró 31 tantos como «rossoneri«. El último gol de Baresi como profesional llego el 27 de agosto de 1995 en el campo del Padova, en un partido correspondiente a la primera jornada de la 1995-1996, su penúltima temporada en activo.
El Milan se impuso 1-2 y el gol de Baresi en el minuto 44 significó la victoria para su equipo. Weah había adelantado nada más arrancar el choque y Amoruso empató en el 34′.
Al finalizar la 1996-1997 colgó las botas con un palmarés envidiable en el que destacan 3 Copas de Europa y 6 Scudettos, pero sin olvidar un Mundial con la «azzurra» y el Balón de Plata de 1989, en el que coparon los tres primeros jugadores «rossoneri».
El club de sus amores retiró su mítico «6». Sin duda una leyenda del verde.