De los 236 tantos que marcó con la camiseta de los Xeneize seguramente el más singular fue el que logró el 13 de noviembre de 1999 y que significó su número 100 en la máxima categoría del fútbol argentino.
Corría el minuto 20 de la primera parte del duelo entre Club Atlético Colón y Boca Juniors cuando Palermo cayó lesionado dentro del área rival. Como pudo continuó sobre el césped y minutos después se desmarcó en el área para recibir un balón filtrado por Riquelme y mandar mansamente la pelota al fondo de las mallas para abrir el marcador.
Tras aquel gol el “Titán” se tuvo que retirar con una ostensible cojera y más tarde se cumplieron los peores pronósticos, tenía destrozados los ligamentos cruzados de su rodilla derecha, una lesión que le mantuvo en el dique seco durante medio año.